番茄（Solanum lycopersicum）SlGLR基因家族的生物信息學(xué)分析.pdf

<p>本研究通過對番茄高質(zhì)量全基因組序列同源搜索分析,找到番茄中共有13個SlGLRs家族成員。并利用生物信息學(xué)方法詳細(xì)分析了該家族所有成員的基因結(jié)構(gòu)、蛋白結(jié)構(gòu)域、進(jìn)化關(guān)系。結(jié)果顯示:番茄SlGLR家族的13個成員均含有57個外顯子,各個成員都包含IPR001828、IPR001320和IPR001638這三個結(jié)構(gòu)域,整個家族可分為三個亞家族,且SlGLR亞家族各成員,除了SlGLR2.6以外均成簇分布在6號染色體上。不同激素處理下的表達(dá)分析顯示該家族不同成員對不同激素處理的響應(yīng)不同;組織表達(dá)分析表明SlGLR3.2在番茄的果實(shí)中特異高表達(dá),暗示其在果實(shí)發(fā)育中可能起著重要作用。為了進(jìn)一步分析其功能,我們對SlGLR3.2的理化性質(zhì)、親水性/疏水性、跨膜區(qū)、亞細(xì)胞定位、蛋白二級結(jié)構(gòu)進(jìn)行了詳細(xì)分析。結(jié)果表明SlGLR3.2為親水性膜蛋白,含有三個跨膜區(qū),二級結(jié)構(gòu)主要由-螺旋、延伸鏈、-轉(zhuǎn)角、無規(guī)則卷曲組成。本研究將為進(jìn)一步研究番茄SlGLRs的功能提供參考依據(jù)。</p>