基于全基因組的番茄YUCCA基因家族生物信息學分析.pdf

YUCCA基因是植物在合成生長素過程中限速酶的編碼基因,植物生長發(fā)育離不開生長素,也同樣離不開YUCCA基因。為深入研究番茄中的YUCCA基因,本研究利用生物信息學方法,在番茄全基因組范圍內共鑒定出了17個YUCCA基因,并對17個YUCCA基因的基本信息、轉錄本結構、保守基序、順式元件、染色體定位、系統(tǒng)發(fā)育以及表達模式進行了分析。結果表明,17個YUCCA基因分布在7條染色體上,并且可以分為三大類A、B、C。YUCCA基因的內含子在0到7之間分布。系統(tǒng)發(fā)育分析表明,同一條染色體上的YUCCA基因有明顯的進化關系。通過以上分析,對后續(xù)深入研究番茄YUCCA基因家族提供了參考。