辣椒HD-ZIP轉(zhuǎn)錄因子家族鑒定與生物信息學分析.pdf
從辣椒基因組數(shù)據(jù)庫中鑒定HD-ZIP轉(zhuǎn)錄因子,并對其進行生物信息學分析。對鑒定到的轉(zhuǎn)錄因子的基本理化性質(zhì)、染色體定位、系統(tǒng)進化、保守基序和基因結(jié)構進行分析。共鑒定到45個辣椒HD-ZIP轉(zhuǎn)錄因子;該家族成員均含有高度保守的HD-ZIP結(jié)構域;45個HD-ZIP基因以不均勻的方式分布在12條染色體上。根據(jù)擬南芥HD-ZIP家族分類關系,在結(jié)合辣椒HD-ZIP基因結(jié)構的特點分為Group、Group、Group和Group。辣椒HD-ZIP轉(zhuǎn)錄因子在同一亞族中含有相同的保守基序和基因結(jié)構。本研究初步明確了辣椒HD-ZIP轉(zhuǎn)錄因子家族成員進化關系和結(jié)構特點,為進一步研究辣椒HD-ZIP轉(zhuǎn)錄因子家族的系統(tǒng)發(fā)育以及生物學功能奠定了基礎,為辣椒的分子育種提供科學依據(jù)。